少數人的免疫系統自體抗體過高，會攻擊胚胎造成胚胎無法著床或反覆流產。可由抽血檢查得知體內是否具有特殊自體抗體。

1. 不明原因不孕、高齡、卵巢早衰(老)、體質過敏者
2. 反覆性流產(習慣性流產)或植入四顆以上好胚胎仍失敗
   ※ 反覆性流產定義: 懷孕未滿20周流產2次以上。
3. 進入試管嬰兒療程客戶皆建議先進行免疫相關檢測，以排除可能導致失敗的因素。

由於免疫治療需長期服藥控制，建議於進入試管嬰兒療程當天進行檢查，亦可在植入前後滾動式動態追蹤免疫指標。

• Anti-TPO：甲狀腺自體免疫抗體
• Anti-ATA：甲狀腺自體免疫抗體
• Anti-ENA(Panel)(套組)
  • SS-A/Ro ：自體抗體；對母體可能引發Sjögren's syndrome(乾燥症)；可通過胎盤造成胎兒先天完全性房室傳導阻塞(CCHB)；新生兒狼瘡。
  • SS-B/La：自體抗體；對母體可能引發Sjögren's syndrome(乾燥症)；可通過胎盤造成胎兒先天完全性房室傳導阻塞(CCHB)；新生兒狼瘡。
  • Jo-1：自體抗體
  • Anti-RNP：自體抗體；紅斑性狼瘡
  • Anti-Smiths Ab：自體抗體；紅斑性狼瘡
  • Scl-70：自體抗體；硬皮症
• APS(套組) 抗磷脂抗體症候群： 習慣性流產、 胚胎萎縮、 胎兒不明原因的早產、 胎兒子宮內生長遲滯、子癇前症、HELLP症候群（HELLP syndrome）之妊娠毒血症、 胎盤灌流不足等
  • Anti-Cardiolipin IgG 
  • Anti-Cardiolipin IgM
  • Anti-β2-Glycoprotein IgG
  • Anti-β2-Glycoprotein IgM
  • Lupus anti-coagulant

血栓相關
皆為凝血相關因子。數量異常時皆可能造成血栓增加，子宮血液循環不佳，使胚胎無法著床或流產。

• D-dimer
• Protein S